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以前に書いた記述は間違っていた
clamd が起動している必要があった

スクリプトを修正した
clamup.sh
/usr/local/etc/rc.d/clamav-clamd stop
/usr/local/etc/rc.d/clamav-freshclam stop
chown -R qscand:qscand /var/run/clamav
chown -R qscand:qscand /var/db/clamav
chown -R qscand:qscand /var/log/clamav
/usr/local/etc/rc.d/clamav-freshclam start
/usr/local/etc/rc.d/clamav-clamd start
sudo -u qscand /usr/local/bin/qmail-scanner-queue.pl -z
chown qscand:qscand /usr/local/qmailscan/qmail-scanner-queue-version.txt